RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 BFSP2Q13515 415 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 TNIP3Q96KP6 325 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 AMACRQ9UHK6 382 aa22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 ERICH4A6NGS2 130 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC188H7C350 402 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 TUSC3Q13454 348 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 TAF5Q15542 800 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FUKQ8N0W3 1084 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SCLYQ96I15 445 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MIS12Q9H081 205 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PSTPIP1O43586 416 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TRADDQ15628 312 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TCTN1Q2MV58 587 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TRNP1Q6NT89 227 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.26■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 EOMESO95936 686 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FAM189BP81408 668 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GUCY2DQ02846 1103 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PRELID2Q8N945 189 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DDHD2O94830 711 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 BCAT1P54687 386 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM110Q86TL2 294 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.25■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 BEST1O76090 585 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TUBBP07437 444 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SETSIPP0DME0 302 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 HSPA6P17066 643 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FLT3P36888 993 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 LRCH4O75427 683 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ERLIN1O75477 346 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RARAP10276 462 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 CCL23P55773 120 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RAB6CQ53S08 254 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TSC2P49815 1807 aa22.24■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 ENPP3O14638 875 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 TTI1O43156 1089 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 LCP1P13796 627 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 RABGGTBP53611 331 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SYT15Q9BQS2 421 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 PITPNM1O00562 1244 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 INPPL1O15357 1258 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SASH3O75995 380 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 LHX1P48742 406 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.23■■□□□ 1.15
RFXAP-201ENST00000255476 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms