RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBPC2Q14324 1141 aa27.82■■■□□ 2.04
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.82■■■□□ 2.04
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CAPNS1-201ENST00000246533 CITO14578 2027 aa27.76■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 AGPAT1Q99943 283 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM31Q9BZY9 425 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 MTA2O94776 668 aa27.75■■■□□ 2.03
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