RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adam22Q9R1V6 904 aa18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf103Q9R1W3 683 aa18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ly6iQ9WU67 134 aa18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam43bA2AM80 330 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lonrf1D3YY23 762 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm5145F8VQ88 278 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 VdrP48281 422 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifit3Q64345 403 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 E2f7Q6S7F2 904 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Apol7cQ8C6E1 369 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam227bQ9D518 532 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tfr2Q9JKX3 798 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam205a1D3YZF6 1314 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BrafP28028 804 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp3caP63328 521 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spink5Q148R4 1017 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Frmd8Q3UFK8 466 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp13a3Q5XF89 1219 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rgl1Q60695 768 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim21Q62191 470 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm2163Q6PCY5 473 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc36a3Q811P0 477 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krt75Q8BGZ7 551 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap28Q8BN58 729 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Thg1lQ9CY52 298 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mxra7Q9CZH7 178 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Poc5Q9DBS8 558 aa18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lcn6A2AJB9 181 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ace3D0G895 737 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm28043E0CXC2 719 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dusp8O09112 663 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Banf1O54962 89 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Enpp1P06802 906 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GssP51855 474 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MyrfQ3UR85 1138 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Akap14Q3V0I7 536 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ptpn14Q62130 1189 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gmcl1Q920G9 524 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tceal1Q921P9 165 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clic3Q9D7P7 237 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erich2E9Q1A6 463 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm20721E9Q2U8 318 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hoxa11P31311 313 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mmp13P33435 472 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 St3gal1P54751 337 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CapslQ6P8Y1 208 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fbxo10Q7TQF2 950 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr792Q7TRH9 311 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbx10Q810F8 385 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dupd1Q8BK84 215 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppm1kQ8BXN7 372 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc12a8Q8VI23 705 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ecrg4Q99LS0 148 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hes6Q9JHE6 224 aa18■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Polr1bP70700 1135 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 VcpQ01853 806 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Glt6d1Q2NKH9 311 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rsrp1Q3UC65 298 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sp4Q62445 782 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cfap36Q8C6E0 343 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9CR55 154 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Apbb2Q9DBR4 760 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim54Q9ERP3 366 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trpm5Q9JJH7 1158 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rfx5Q9JL61 658 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psmd13Q9WVJ2 376 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eya4Q9Z191 616 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfml2bQ3V1G4 746 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GcgrQ61606 485 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hmgb4Q6P8W9 181 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pkn2Q8BWW9 983 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Commd10Q8JZY2 202 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pacs1Q8K212 961 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ssx2ipQ8VC66 615 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc1Q91Z38 292 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vta1Q9CR26 309 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zcchc12Q9CZA5 402 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr220E9Q050 325 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stt3aP46978 705 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pfdn4Q3UWL8 134 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scarf1Q5ND28 820 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nrde2Q80XC6 1172 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim61Q8JZK6 461 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Acat1Q8QZT1 424 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TgdsQ8VDR7 355 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc14a1Q8VHL0 384 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ndufb5Q9CQH3 189 aa17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Isl2Q9CXV0 359 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.6 ms