RNA–Protein interactions for RNA: YNL237W

YTP1, Transcript of Probable type-III integral membrane protein of unknown function, yeast

Gene YTP1, Length 1,380 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YTP1	YNL237W	CSM4	Q08955	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YKL102C	P34249	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	RPA43	P46669	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	COA6	Q3E846	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	MRPL44	P19956	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YKR032W	P36127	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	AME1	P38313	324 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	TEM1	P38987	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	ATG33	Q06485	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	PHO85	P17157	305 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	TCA17	P32613	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	SPI1	P40092	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	COX2	P00410	251 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	INO2	P26798	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	YGR017W	P53210	297 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	NAT5	Q08689	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YTP1	YNL237W	PAU16	P35994	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MIC12	P38341	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YHL044W	P38727	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	POR2	P40478	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YPI1	P43587	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	TRI1	Q05024	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MHR1	Q06630	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	DAD1	Q12248	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MRP10	O75012	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MDM10	P18409	493 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	POM33	Q12164	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	SEC11	P15367	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YCR041W	P37265	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	PAU7	P39545	55 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MST28	P39552	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	FIP1	P45976	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	BNA1	P47096	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	TOS8	P53147	276 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MST27	P53176	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	CAX4	P53223	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	UBC7	Q02159	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	GTO3	Q04806	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MSC3	Q05812	728 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	ATG39	Q06159	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	ERS1	P17261	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	CMC1	P36064	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	VPS55	P47111	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YJR096W	P47137	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	ABM1	P47146	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	CAB4	P53332	305 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	PRM7	Q12459	698 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YFR035C	P43608	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	YGL118C	P53132	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	GPI19	Q04082	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	FYV7	Q12247	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YTP1	YNL237W	DYN1	P36022	4092 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	ATP5	P09457	212 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	YHR022C	P38763	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	SNF11	P38956	169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	YGL230C	P53074	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	NCE103	P53615	221 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	SPG4	Q04438	115 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	DPP1	Q05521	289 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	HOR7	Q05827	59 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	SRL1	Q08673	210 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	TIM22	Q12328	207 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YTP1	YNL237W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms