RNA–Protein interactions for RNA: YLR362W

STE11, Transcript of Signal transducing MEK kinase, yeast

Gene STE11, Length 2,154 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE11	YLR362W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YFR045W	P43617	309 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	IMP2	P46972	177 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YJL163C	P46996	555 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	AIM24	P47127	394 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YGR025W	P53216	100 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	ATP19	P81451	68 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MRX11	Q03079	207 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MHR1	Q06630	226 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	CSM4	Q08955	156 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	JID1	Q12350	301 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	COA6	Q3E846	104 aa		1.92	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MRS1	P07266	363 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	HMRA1	P0CY11	126 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	ACP1	P32463	125 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	TIR2	P33890	251 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YKL075C	P36083	450 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MBB1	P39534	108 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	BRP1	P53194	125 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	ATG33	Q06485	197 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	IRC25	Q07951	179 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	NAT5	Q08689	176 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	RKI1	Q12189	258 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	CPT1	P17898	393 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	ZRT1	P32804	376 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	YPT10	P38146	199 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	RPB11	P38902	120 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	TEM1	P38987	245 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	LCB3	P47013	409 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	TDA4	P47153	279 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	SDS23	P53172	527 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	DAD4	P69851	72 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	GIM5	Q04493	163 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	POM33	Q12164	279 aa		1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	1.91	□□□□□ -2.1
STE11	YLR362W	HTB2	P02294	131 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	CYC3	P06182	269 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	PAU16	P35994	123 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	PET8	P38921	284 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	RPA43	P46669	326 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YDL183C	P48569	320 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YOL160W	Q08321	113 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YDL157C	Q12082	118 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	SCS22	Q6Q595	175 aa		1.9	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	MDM10	P18409	493 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	RRT1	P38192	103 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	AME1	P38313	324 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	BNA1	P47096	177 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YIP1	P53039	248 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YGR219W	P53307	113 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YMR181C	Q03231	154 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	SDH7	Q04401	133 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	TIM18	Q08749	192 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YPR013C	Q12145	317 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	ATP5	P09457	212 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YKR032W	P36127	104 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	1.89	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	SAL1	D6W196	494 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	SEC11	P15367	167 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	HAC1	P41546	238 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	SAE3	P89114	91 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	MSC3	Q05812	728 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	FYV7	Q12247	151 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	COX2	P00410	251 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.88	□□□□□ -2.11	not detected
STE11	YLR362W	SPI1	P40092	148 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	TRI1	Q05024	226 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YLR281C	Q05863	155 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	DAD1	Q12248	94 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		1.88	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	PHO85	P17157	305 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	INO2	P26798	304 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	UTR5	P32630	166 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	MIC12	P38341	106 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YPI1	P43587	155 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YJR096W	P47137	282 aa		1.87	□□□□□ -2.11
STE11	YLR362W	YGL230C	P53074	147 aa		1.87	□□□□□ -2.11

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.9 ms