RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	VTN	P04004	478 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GCA	P28676	217 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TAP1	Q03518	808 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152		M0QYV0	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	INSRR	P14616	1297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	COPS2	P61201	443 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MED7	O43513	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	HBP1	O60381	514 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GRAP2	O75791	330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MAML1	Q92585	1016 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	UBOX5	O94941	541 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A27	O95847	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ITGAV	P06756	1048 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KDELR1	P24390	212 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SSTR1	P30872	391 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CDO1	Q16878	200 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CENPU	Q71F23	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	P3H4	Q92791	437 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EVPL	Q92817	2033 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SI	P14410	1827 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MICAL2	O94851	1124 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KRT7	P08729	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MIP	P30301	263 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	HIF1A	Q16665	826 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SUN1	O94901	812 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2C8	P10632	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GHR	P10912	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FOXN2	P32314	431 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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