RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634860.1

EP300-206, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 3

Gene EP300, Length 428 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-206	ENST00000634860	SYK	P43405	635 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	NLRP12	P59046	1061 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TRPC3	Q13507	836 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MMS19	Q96T76	1030 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LRRN2	O75325	713 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CYP2F1	P24903	491 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	AVPR1A	P37288	418 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TNNC1	P63316	161 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CLDN10	P78369	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	FZD5	Q13467	585 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	BECN1	Q14457	450 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	DDR2	Q16832	855 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	IKBKB	O14920	756 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PHACTR2	O75167	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PFKL	P17858	780 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LMO2	P25791	158 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	GPR15	P49685	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PDE6C	P51160	858 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	NDUFA8	P51970	172 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CYP4F8	P98187	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LRRC32	Q14392	662 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	NFIL3	Q16649	462 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EP300-206	ENST00000634860	CIT	O14578	2027 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	MAPK13	O15264	365 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	NR3C1	P04150	777 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	CCNE1	P24864	410 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	ANXA13	P27216	316 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	PPP3CC	P48454	512 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	CDR1	P51861	262 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	MYL6	P60660	151 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	AMPD2	Q01433	879 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EP300-206	ENST00000634860	ENPEP	Q07075	957 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms