RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 NETO1Q8TDF5 533 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB23Q9ULC3 237 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TSC2P49815 1807 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GTH6 734 aa25.92■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP3A5P20815 502 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CTHP32929 405 aa25.92■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 HPS3Q969F9 1004 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TSG101Q99816 390 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.92■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 SOAT2O75908 522 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ALCAMQ13740 583 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 NR1I3Q14994 352 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SFR1Q86XK3 245 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF12Q96FN5 646 aa25.91■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 PSMG2Q969U7 264 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA6P31267 233 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHB3P54753 998 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 DRC7Q8IY82 874 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
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CAPNS1-216ENST00000628306 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 YAF2Q8IY57 180 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CHFRQ96EP1 664 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 STRA6Q9BX79 667 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.88■■□□□ 1.73
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