RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 A8MXQ7 604 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CSH1P0DML2 217 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CSH2P0DML3 217 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 COL9A1P20849 921 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FCARP24071 287 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CDC25CP30307 473 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GPR15P49685 360 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CDH8P55286 799 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CAMK4Q16566 473 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FBXL6Q8N531 539 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SMARCD2Q92925 531 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ELSPBP1Q96BH3 223 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SDCBP2Q9H190 292 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TRPV4Q9HBA0 871 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 BICDL2A1A5D9 508 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ASPAP45381 313 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MXI1P50539 228 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 DDR2Q16832 855 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GPR152Q8TDT2 470 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 NELFBQ8WX92 580 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 BCO2Q9BYV7 579 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ZFP14Q9HCL3 533 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 RAP1GAPP47736 663 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CYP27A1Q02318 531 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.54■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 NOL4O94818 638 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 BDNFP23560 247 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TNIP3Q96KP6 325 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SPATA17Q96L03 361 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MYRFLQ96LU7 910 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GCNAQ96QF7 691 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ZMYM5Q9UJ78 669 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 F5P12259 2224 aa26.53■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CFHP08603 1231 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GPC5P78333 572 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 PAK1Q13153 545 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SDHAF4Q5VUM1 108 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 UNC93AQ86WB7 457 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SLC35C1Q96A29 364 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CYP3A43Q9HB55 503 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SLC38A8A6NNN8 435 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 F11P03951 625 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 WEE1P30291 646 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 NLRP12P59046 1061 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 INCA1Q0VD86 236 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 STXBP5Q5T5C0 1151 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 SEMA4DQ92854 862 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 E2F7Q96AV8 911 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 GBP4Q96PP9 640 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 RAB20Q9NX57 234 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TRIM66O15016 1216 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 GPR158Q5T848 1215 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 SIX5Q8N196 739 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 STKLD1Q8NE28 680 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-220ENST00000618056 TASP1Q9H6P5 420 aa26.5■■□□□ 1.83
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