RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 CREB5Q02930 508 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TAF12Q16514 161 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GPR158Q5T848 1215 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 BEST2Q8NFU1 509 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CNTN3Q9P232 1028 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 KIAA1468Q9P260 1216 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 C4orf47A7E2U8 309 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CLDN3O15551 220 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 OAZ2O95190 189 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GARTP22102 1010 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CASP5P51878 434 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MCL1Q07820 350 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PLK5Q496M5 336 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TTC8Q8TAM2 541 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PSMG2Q969U7 264 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ACDQ96AP0 544 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CDT1Q9H211 546 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM9BQ9NQ34 198 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 DACH1Q9UI36 760 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 USP20Q9Y2K6 914 aa13.92□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 NCANO14594 1321 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PSMA7O14818 248 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 DRD1P21728 446 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GABRR2P28476 465 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GBP1P32455 592 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 STK4Q13043 487 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GPR17Q13304 367 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CAMK4Q16566 473 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TMC8Q8IU68 726 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TSG101Q99816 390 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SLC32A1Q9H598 525 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TASP1Q9H6P5 420 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 STYXL1Q9Y6J8 313 aa13.91□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CITO14578 2027 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 OGTO15294 1046 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 APBB3O95704 486 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 EDN1P05305 212 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PAX3P23760 479 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 AVPR1AP37288 418 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 BFSP1Q12934 665 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 DUSP4Q13115 394 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MORC3Q14149 939 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MYBPC2Q14324 1141 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CEP120Q8N960 986 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 HPS3Q969F9 1004 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 KIF12Q96FN5 646 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 LRRC3Q9BY71 257 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 LHX6Q9UPM6 363 aa13.9□□□□□ -0.18
FCHO1-225ENST00000598539 IGF2RP11717 2491 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TRIP11Q15643 1979 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 BICDL2A1A5D9 508 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms