RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYND10O75800 440 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TARSP26639 723 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 RBP5P82980 135 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SHC2P98077 582 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ACAP1Q15027 740 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS16Q9H269 839 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST7Q9NS84 486 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIP11Q15643 1979 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK6Q96HP0 2047 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GTH6 734 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PMLP29590 882 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ATICP31939 592 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PNPLA4P41247 253 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPC3Q13507 836 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR65Q8IYL9 337 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF4BQ92750 862 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF560Q96MR9 790 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO9A1A5B4 782 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1G1P47890 313 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 MTAPQ13126 283 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 FZD5Q13467 585 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 LPAL2Q16609 132 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CBWD6Q4V339 395 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 FGF13Q92913 245 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 FNIP2Q9P278 1114 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGB3P05106 788 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TDGF1P13385 188 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3CAP42336 1068 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 UBASH3AP57075 661 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOA4Q13772 614 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CSRP2Q16527 193 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 GBP6Q6ZN66 633 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 TPRG1Q6ZUI0 275 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 CXorf38Q8TB03 319 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-214ENST00000592483 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PIRO00625 290 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HLA-DRAP01903 254 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY1Q08828 1119 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO1EQ12965 1108 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 UPP1Q16831 310 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB20Q9NX57 234 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SIX4Q9UIU6 781 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FRYQ5TBA9 3013 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PODXLO00592 558 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 VNN1O95497 513 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT19P08727 400 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R5DQ14738 602 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQC6 194 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNA4P22459 653 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF6P49848 677 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GUCY2FP51841 1108 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 NTHL1P78549 312 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CREMQ03060 361 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 UBXN1Q04323 297 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 NR1I3Q14994 352 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SV2CQ496J9 727 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-214ENST00000592483 KXD1Q9BQD3 176 aa25.24■■□□□ 1.63
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