RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPYD	Q12882	1025 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDR2	Q16832	855 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDXK	O00764	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIF20A	O95235	890 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDC25C	P30307	473 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYL6	P60660	151 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	RUBCN	Q92622	972 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	IRF7	Q92985	503 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSH1	P0DML2	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSH2	P0DML3	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLG4	P78352	724 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	OBSL1	O75147	1896 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCAN	O14594	1321 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	F11	P03951	625 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SP9	P0CG40	484 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	BDNF	P23560	247 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATIC	P31939	592 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRIK1	P39086	918 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	AP3M2	P53677	418 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NLRP12	P59046	1061 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PNOC	Q13519	176 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989		A8MXQ7	604 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCAM2	O15394	837 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TACC1	O75410	805 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLUL	P15104	373 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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