RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.444e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-207ENST00000589146 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 HIPK3Q9H422 1215 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CYLDQ9NQC7 956 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 HCRTO43612 131 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM110Q86TL2 294 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT35Q92764 455 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 EHD2Q9NZN4 543 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAT1P54687 386 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX16P57768 344 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DSEQ9UL01 958 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX21Q9UL17 535 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ODC1P11926 461 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TYMPP19971 482 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TCTN1Q2MV58 587 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SUSD3Q96L08 255 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNCQ9H7C4 482 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CDH9Q9ULB4 789 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PSTPIP1O43586 416 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GAT3O94766 335 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DDHD2O94830 711 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 GJB6O95452 261 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBBP07437 444 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT3P12035 628 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 RWDD2BP57060 319 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE4CQ08493 712 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf54Q08AI8 447 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PMF1Q6P1K2 205 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 MCEEQ96PE7 176 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PCNTO95613 3336 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TSC2P49815 1807 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA2O43364 376 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC130P13994 396 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SCNN1AP37088 669 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCKSL1P49006 195 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCB3Q01970 1234 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 OGDHQ02218 1023 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC38Q5VT99 294 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL23Q86XA0 190 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 HSFY1Q96LI6 401 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-207ENST00000589146 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PCSK1P29120 753 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RFC2P35250 354 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ACADSBP45954 432 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G4AP47712 749 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ACAP1Q15027 740 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 FUKQ8N0W3 1084 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SCLYQ96I15 445 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CASD1Q96PB1 797 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT15Q9BQS2 421 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ACBD6Q9BR61 282 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP16Q9BY84 665 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.01■■□□□ 1.43
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