RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581578.5

GPS1-215, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 4

Gene GPS1, Length 470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-215	ENST00000581578	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ORC1	Q13415	861 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578		A0A1W2PRU2	124 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CLDN5	O00501	218 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FGF19	O95750	216 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CSH1	P0DML2	217 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CSH2	P0DML3	217 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GABRR2	P28476	465 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CCR2	P41597	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TDG	Q13569	410 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	EDA	Q92838	391 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MED15	Q96RN5	788 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MICAL2	O94851	1124 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	EPHA5	P54756	1037 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ZXDA	P98168	799 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TEAD2	Q15562	447 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TRIM66	O15016	1216 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	P4HA2	O15460	535 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	MOSPD3	O75425	235 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CDC25C	P30307	473 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	TSC2	P49815	1807 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578		F8VP50	259 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	PMM2	O15305	246 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CILP	O75339	1184 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	AP1G2	O75843	785 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC130	P13994	396 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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