RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FUT8Q9BYC5 575 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1B1P15313 513 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 V9GYQ6 96 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087X0T9 212 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FAM228BP0C875 321 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ITIH4Q14624 930 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HORMAD1Q86X24 394 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HPDLQ96IR7 371 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MSH4O15457 936 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 IRF1P10914 325 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NPEPPSP55786 919 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ETFBP38117 255 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 WDR93Q6P2C0 686 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CNBD2Q96M20 576 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PTK6Q13882 451 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRB3O60242 1522 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CEP78Q5JTW2 689 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD8Q96I13 439 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB18Q96M61 343 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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PTPRM-211ENST00000580170 SH3GL1Q99961 368 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ITGA4P13612 1032 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT2P50583 147 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HERVK_113P62684 666 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DSG1Q02413 1049 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SNX17Q15036 470 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH10BP0C881 870 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FAXCQ5TGI0 409 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 IER5Q5VY09 327 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CASP10Q92851 521 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NTSR2O95665 410 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ITGB3P05106 788 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf20Q8ND61 904 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CNDP1Q96KN2 507 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CYP11B2P19099 503 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-211ENST00000580170 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NCAM1P13591 858 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HOXD10P28358 340 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 SGO1Q5FBB7 561 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 WLSQ5T9L3 541 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 APOL5Q9BWW9 433 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HEY2Q9UBP5 337 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NPTXRO95502 500 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FDFT1P37268 417 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RHOBTB1O94844 696 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 AVPR1AP37288 418 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ADCK2Q7Z695 626 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC103Q8IW40 242 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 HAO1Q9UJM8 370 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 E7ENQ6 273 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 STK25O00506 426 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MAFGO15525 162 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 RCN1Q15293 331 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 MTSS1O43312 755 aa22.16■■□□□ 1.14
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