RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561991.5

PKD1-224, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 964 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-224	ENST00000561991	ING5	Q8WYH8	240 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CISH	Q9NSE2	258 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PTPRD	P23468	1912 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CCDC130	P13994	396 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GJA1	P17302	382 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PTPN2	P17706	415 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	EPHB3	P54753	998 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MYL5	Q02045	173 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MTMR3	Q13615	1198 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MAN2A1	Q16706	1144 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	RRAGA	Q7L523	313 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GJD3	Q8N144	294 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	UBR7	Q8N806	425 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ABCB6	Q9NP58	842 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GCNT4	Q9P109	453 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MUC3A	Q02505	3323 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MOSPD3	O75425	235 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MYL4	P12829	197 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CEBPB	P17676	345 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SLC9A1	P19634	815 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PLD1	Q13393	1074 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	VWA3B	Q502W6	1294 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GJB7	Q6PEY0	223 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	UNC93A	Q86WB7	457 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ELMOD1	Q8N336	334 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PSMG2	Q969U7	264 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NDST4	Q9H3R1	872 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CALCA	P01258	141 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RAD23B	P54727	409 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	CETN1	Q12798	172 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KRT31	Q15323	416 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	IQCE	Q6IPM2	695 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FAM35A	Q86V20	835 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FUK	Q8N0W3	1084 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991		F8VP50	259 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF18	P17022	549 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ADORA2B	P29275	332 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	GRIK1	P39086	918 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MAGEA11	P43364	429 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	EPHA5	P54756	1037 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	FGF13	Q92913	245 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	VPS16	Q9H269	839 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SIX2	Q9NPC8	291 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	NR2E1	Q9Y466	385 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	BEST1	O76090	585 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	ATP1A3	P13637	1013 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	PON1	P27169	355 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PKD1-224	ENST00000561991	VEPH1	Q14D04	833 aa		18.81	■□□□□ 0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms