RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560754.1

RNF31-223, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 3

Gene RNF31, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-223	ENST00000560754	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	INTS13	Q9NVM9	706 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	USP18	Q9UMW8	372 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	MTMR6	Q9Y217	621 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	PTPRD	P23468	1912 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	ATG13	O75143	517 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	HOXD13	P35453	343 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	STAT6	P42226	847 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	MAGEA11	P43364	429 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	GPR15	P49685	360 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	GALK1	P51570	392 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	AMPD2	Q01433	879 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	OSTM1	Q86WC4	334 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	GPD1L	Q8N335	351 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	RIN3	Q8TB24	985 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	EBF3	Q9H4W6	596 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	LAMA1	P25391	3075 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ZNF233	A6NK53	670 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	TADA3	O75528	432 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	FAM163B	P0C2L3	166 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PCSK1	P29120	753 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	BFSP1	Q12934	665 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PDGFRL	Q15198	375 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	SURF1	Q15526	300 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	FAM84A	Q96KN4	292 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	GCNT4	Q9P109	453 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CACNA1B	Q00975	2339 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	SLC30A4	O14863	429 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	KRT19	P08727	400 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	TCF3	P15923	654 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	DRD1	P21728	446 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	LMO2	P25791	158 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	RAP1GAP	P47736	663 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	MYO1E	Q12965	1108 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	E2F4	Q16254	413 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PDILT	Q8N807	584 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	STKLD1	Q8NE28	680 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	HPDL	Q96IR7	371 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	SPATA17	Q96L03	361 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	SLC22A12	Q96S37	553 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	TNMD	Q9H2S6	317 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PTPRJ	Q12913	1337 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	HCRT	O43612	131 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ATP2C2	O75185	946 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	USP17L7	P0C7H9	530 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	ARSA	P15289	507 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	GJA4	P35212	333 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	VSTM1	Q6UX27	236 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RNF31-223	ENST00000560754	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		14.62	□□□□□ -0.07

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