RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1W2PRU2	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	GABRD	O14764	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	IKBKB	O14920	756 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ADORA2B	P29275	332 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	USP46	P62068	366 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	MYL7	Q01449	175 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ZP2	Q05996	745 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR17	Q13304	367 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SURF1	Q15526	300 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SUSD6	Q92537	303 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573		H7C4K7	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	RHO	P08100	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	CEBPB	P17676	345 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	TYMP	P19971	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PNPLA4	P41247	253 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP4F8	P98187	520 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PLD1	Q13393	1074 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PKMYT1	Q99640	499 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	NCAN	O14594	1321 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNJ18	B7U540	433 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	DLL1	O00548	723 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	LRG1	P02750	347 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	CFH	P08603	1231 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNJ12	Q14500	433 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	NCAPH	Q15003	741 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FAM227B-208	ENST00000559573	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573		F8VP50	259 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GJD3	Q8N144	294 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FGF14	Q92915	247 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CISH	Q9NSE2	258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	EPHB6	O15197	1021 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ABL1	P00519	1130 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GRIK1	P39086	918 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	VIPR2	P41587	438 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPY1	Q01534	308 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TEAD2	Q15562	447 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	STX1A	Q16623	288 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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