RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM11Q96F44 468 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 MYH10P35580 1976 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 FAM170AA1A519 330 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ABCB4P21439 1286 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ANKS3Q6ZW76 656 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 STK39Q9UEW8 545 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 A0A0U1RQJ8 604 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 RCCD1A6NED2 376 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 OR6C75A6NL08 312 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM253P0C7T8 217 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 BCAT1P54687 386 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 SLC8A3P57103 927 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 UBA3Q8TBC4 463 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 B3GALT6Q96L58 329 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 TFR2Q9UP52 801 aa25.28■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 EFEMP2O95967 443 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 SETSIPP0DME0 302 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 KRT17Q04695 432 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.27■■□□□ 1.64
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 SOD2P04179 222 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MYBL1P10243 752 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP25P42331 645 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 GPC5P78333 572 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PLCB3Q01970 1234 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 RTP2Q5QGT7 225 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 LIN9Q5TKA1 542 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 FAM171BQ6P995 826 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 ERICH1Q86X53 443 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 FUKQ8N0W3 1084 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF653Q96CK0 615 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PCED1BQ96HM7 432 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 CALB1P05937 261 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 GPD2P43304 727 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 TTC30AQ86WT1 665 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MYLPFQ96A32 169 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 THAP2Q9H0W7 228 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 COL6A3P12111 3177 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 FAM200BP0CF97 657 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MMP8P22894 467 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC142Q17RM4 750 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PKDCCQ504Y2 493 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MON1BQ7L1V2 547 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM209Q96SK2 561 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 SYNCQ9H7C4 482 aa25.25■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 LCHNA4D1U4 455 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 CLDN5O00501 218 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 FGF18O76093 207 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 RABGGTBP53611 331 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 SNX16P57768 344 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 FAM35AQ86V20 835 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PKMYT1Q99640 499 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 DUSP16Q9BY84 665 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 MIS12Q9H081 205 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 CHST7Q9NS84 486 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 KIF5CO60282 957 aa25.23■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 GLUD2P49448 558 aa25.23■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MEIS3-204ENST00000558555 PDE4CQ08493 712 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms