RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	PI15	O43692	258 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	MICAL2	O94851	1124 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	EPHB3	P54753	998 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CETN1	Q12798	172 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	FGF19	O95750	216 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ATF6	P18850	670 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEA11	P43364	429 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	STX17	P56962	302 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TEAD2	Q15562	447 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RBM23-231	ENST00000557549	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.15	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	MYH10	P35580	1976 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PRU2	124 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	STK25	O00506	426 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	ATP2C2	O75185	946 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	ECI2	O75521	394 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	FCAR	P24071	287 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	LMO2	P25791	158 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	FMO5	P49326	533 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	GPR15	P49685	360 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	CLCN5	P51795	746 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	TCF15	Q12870	199 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBM23-231	ENST00000557549	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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