RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CEP72	Q9P209	647 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	L1RE1	Q9UN81	338 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	YIPF1	Q9Y548	306 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CCL16	O15467	120 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	EXOC3	O60645	756 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	HUS1	O60921	280 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NR3C1	P04150	777 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FCAR	P24071	287 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PCSK1	P29120	753 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	GTF2H1	P32780	548 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PPP1R2	P41236	205 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	EPHB3	P54753	998 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	MYL7	Q01449	175 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TWF1	Q12792	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	DUSP4	Q13115	394 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ZACN	Q401N2	412 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	WSCD1	Q658N2	575 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	VSTM1	Q6UX27	236 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ITIH5	Q86UX2	942 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ELMOD1	Q8N336	334 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ITFG1	Q8TB96	612 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FGF14	Q92915	247 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SMARCD2	Q92925	531 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ASB16	Q96NS5	453 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CDK15	Q96Q40	435 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FNBP1	Q96RU3	617 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ASAH2	Q9NR71	780 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	OBP2A	Q9NY56	170 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CDH9	Q9ULB4	789 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FRYL	O94915	3013 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	VWA8	A3KMH1	1905 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ARNTL	O00327	626 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PMM2	O15305	246 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	AKAP3	O75969	853 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NOL4	O94818	638 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SMC2	O95347	1197 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ASGR2	P07307	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	OR4Q2	P0C623	313 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	GLUL	P15104	373 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NPR3	P17342	541 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PFKL	P17858	780 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	ATF6	P18850	670 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TNNI1	P19237	187 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	AOC1	P19801	751 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CCR2	P41597	374 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	CYP2J2	P51589	502 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	STARD6	P59095	220 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	NTHL1	P78549	312 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TSPY1	Q01534	308 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PFKP	Q01813	784 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PRKCQ	Q04759	706 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	LRRC63	Q05C16	580 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSMA3-208	ENST00000555743	PARM1	Q6UWI2	310 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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