RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CASP1	P29466	404 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GJA4	P35212	333 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PNPLA4	P41247	253 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DPP6	P42658	865 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PDE6C	P51160	858 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GTF2B	Q00403	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TSPY1	Q01534	308 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LMAN2	Q12907	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DMC1	Q14565	340 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	WSCD1	Q658N2	575 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TXNDC8	Q6A555	127 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GPBP1	Q86WP2	473 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MYCT1	Q8N699	235 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPATA18	Q8TC71	538 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CHFR	Q96EP1	664 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	AK8	Q96MA6	479 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM206	Q9H813	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PARVG	Q9HBI0	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DPP3	Q9NY33	737 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CFAP45	Q9UL16	551 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CCL26	Q9Y258	94 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPTBN2	O15020	2390 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LNP1	A1A4G5	178 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		K7ENM7	598 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PPEF2	O14830	753 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CUTA	O60888	179 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PPP6R2	O75170	966 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NOL4	O94818	638 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FAM13A	O94988	1023 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	IL18RAP	O95256	599 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NFIC	P08651	508 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF9	P0C862	333 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ARSA	P15289	507 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TCF3	P15923	654 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PFKFB1	P16118	471 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HOXC13	P31276	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GBP1	P32455	592 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TXLNA	P40222	546 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	STAT6	P42226	847 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	IFNAR2	P48551	515 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DGKE	P52429	567 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZNF131	P52739	623 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FOXC1	Q12948	553 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PSMD2	Q13200	908 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MTF1	Q14872	753 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	POSTN	Q15063	836 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SV2C	Q496J9	727 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ARSH	Q5FYA8	562 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PMS2CL	Q68D20	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RAD54L	Q92698	747 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TCEAL3	Q969E4	200 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ZNF560	Q96MR9	790 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ACBD6	Q9BR61	282 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	REEP2	Q9BRK0	252 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC32A1	Q9H598	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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