RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MYH10P35580 1976 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SYCE3A1L190 88 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TRIM66O15016 1216 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 HCRTO43612 131 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LRRN2O75325 713 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CILPO75339 1184 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MICAL2O94851 1124 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 RHOP08100 348 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CSH1P0DML2 217 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CSH2P0DML3 217 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CD58P19256 250 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 FSHRP23945 695 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CYP2F1P24903 491 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ANXA13P27216 316 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZNF165P49910 485 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZP2Q05996 745 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 NFKBIBQ15653 356 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ACOT1Q86TX2 421 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LMO3Q8TAP4 145 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 PSMG2Q969U7 264 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MYLPFQ96A32 169 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CORO1BQ9BR76 489 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MED10Q9BTT4 135 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ASAH2Q9NR71 780 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 FANCLQ9NW38 375 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GCNT4Q9P109 453 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CEP72Q9P209 647 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 BECN2A8MW95 431 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 BDNFP23560 247 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GRIK1P39086 918 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 EPHA5P54756 1037 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MFAP3P55082 362 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TPM4P67936 248 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GCNT1Q02742 428 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LRMPQ12912 555 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GJD3Q8N144 294 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SPATA17Q96L03 361 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 C8orf48Q96LL4 319 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GPR88Q9GZN0 384 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CDH22Q9UJ99 828 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 NME7Q9Y5B8 376 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 NOTCH4Q99466 2003 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 C5orf42Q9H799 3197 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SOAT2O75908 522 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MYL4P12829 197 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ATF6P18850 670 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 CDC25CP30307 473 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 RAD23BP54727 409 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 SLC8A3P57103 927 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 NTHL1P78549 312 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 DDR2Q16832 855 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 ZNF394Q53GI3 561 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 MIIPQ5JXC2 388 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GIPC2Q8TF65 315 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 NXPE3Q969Y0 559 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 GCNAQ96QF7 691 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-224ENST00000551155 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms