RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	PHOX2B	Q99453	314 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SYT15	Q9BQS2	421 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NCAN	O14594	1321 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	COL4A2	P08572	1712 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	USP34	Q70CQ2	3546 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZNF263	O14978	683 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NCAM2	O15394	837 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	RFX1	P22670	979 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GDI1	P31150	447 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MYL6	P60660	151 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FZD5	Q13467	585 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TRPC3	Q13507	836 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GRM2	Q14416	872 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TAF12	Q16514	161 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZACN	Q401N2	412 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GCNA	Q96QF7	691 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.28	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		12.27	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		12.27	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FAM170B	A6NMN3	283 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	HCRT	O43612	131 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ATP2C2	O75185	946 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	CASP4	P49662	377 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PLCB2	Q00722	1185 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	NCOA4	Q13772	614 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	DDR2	Q16832	855 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TAF4B	Q92750	862 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TIGD1	Q96MW7	591 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	BCO2	Q9BYV7	579 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	SNX25	Q9H3E2	840 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	NME7	Q9Y5B8	376 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ZNF292	O60281	2723 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PTPRD	P23468	1912 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	DPYSL4	O14531	572 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PHACTR2	O75167	634 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	VNN1	O95497	513 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF12	O95522	483 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PDGFRB	P09619	1106 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PFKL	P17858	780 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	GPR15	P49685	360 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	TNNC1	P63316	161 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	DLG4	P78352	724 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	CYP4F8	P98187	520 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	MYLPF	Q96A32	169 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CS-223	ENST00000551137	PCED1B	Q96HM7	432 aa		12.26	□□□□□ -0.45

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