RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 JAM2P57087 298 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CREMQ03060 361 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 DSC1Q08554 894 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCY1Q08828 1119 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CETN1Q12798 172 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R5DQ14738 602 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 USP37Q86T82 979 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 TISP43B9A030 160 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF2H1P32780 548 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 NTHL1P78549 312 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 MYL7Q01449 175 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 ASIC2Q16515 512 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 USP41Q3LFD5 358 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP4Q96MN2 994 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR24Q96S15 920 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 KXD1Q9BQD3 176 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 DEF6Q9H4E7 631 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PJA2O43164 708 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNA4P22459 653 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 STRN3Q13033 797 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 UBXN11Q5T124 520 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1328Q86T90 577 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 DEPTORQ8TB45 409 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM143Q96AN5 459 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 B3GALT6Q96L58 329 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 SPAG5Q96R06 1193 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP8B3O60423 1300 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 F8W810 466 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 FANCGO15287 622 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 AKR1B10O60218 316 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 GDF9O60383 454 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 EFNA5P52803 228 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CBWD6Q4V339 395 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 FUT10Q6P4F1 479 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 GPD1LQ8N335 351 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 LMO3Q8TAP4 145 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 IER2Q9BTL4 223 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 STK33Q9BYT3 514 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRDQ9H2X0 955 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A0U1RQJ8 604 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL5CA6NH57 179 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF263O14978 683 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 GFPT2O94808 682 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 PROS1P07225 676 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM49P0CI25 452 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM49CP0CI26 452 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGA4P13612 1032 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 FERP16591 822 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXA9P31269 272 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 IL31Q6EBC2 164 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 RDH13Q8NBN7 331 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ITFG1Q8TB96 612 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.33■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 SHISA7A6NL88 538 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 K7ERI5 159 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ASAP2O43150 1006 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CTDSP2-204ENST00000548823 ADRB2P07550 413 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms