RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547637.1

SMARCD1-204, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 1, human

TSL 2

Gene SMARCD1, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCD1-204	ENST00000547637	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMARCD1-204	ENST00000547637	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMARCD1-204	ENST00000547637	L1RE1	Q9UN81	338 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMARCD1-204	ENST00000547637	CCL26	Q9Y258	94 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMARCD1-204	ENST00000547637	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
SMARCD1-204	ENST00000547637	FRYL	O94915	3013 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	TNNC2	P02585	160 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CYP2F1	P24903	491 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PDE6C	P51160	858 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CUL4A	Q13619	759 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	WDR44	Q5JSH3	913 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GPD1L	Q8N335	351 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GAB3	Q8WWW8	586 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	HPS4	Q9NQG7	708 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	IFNAR2	P48551	515 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	IL31	Q6EBC2	164 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MYRFL	Q96LU7	910 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	EHD2	Q9NZN4	543 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ZNF233	A6NK53	670 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	NOL4	O94818	638 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CKM	P06732	381 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GPR15	P49685	360 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MTF1	Q14872	753 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	TTC16	Q8NEE8	873 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ATP2A3	Q93084	1043 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PANK2	Q9BZ23	570 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SPTBN2	O15020	2390 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	AXIN1	O15169	862 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	AKAP3	O75969	853 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GALK1	P51570	392 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	KCNB1	Q14721	858 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ECT2	Q9H8V3	914 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GABRD	O14764	452 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	RNF40	O75150	1001 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ADRB1	P08588	477 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ARSA	P15289	507 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SYT1	P21579	422 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	MAGEA11	P43364	429 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CASP5	P51878	434 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	AMPD3	Q01432	767 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	SLC39A14	Q15043	492 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PPM1J	Q5JR12	505 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ACD	Q96AP0	544 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	HPDL	Q96IR7	371 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CDH9	Q9ULB4	789 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	EGF	P01133	1207 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ANXA13	P27216	316 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	GJA4	P35212	333 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	REST	Q13127	1097 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	VSTM1	Q6UX27	236 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CD101	Q93033	1021 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	INTS13	Q9NVM9	706 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMARCD1-204	ENST00000547637	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	24.7	■■□□□ 1.54
SMARCD1-204	ENST00000547637	ZNF806	P0C7X5	589 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMARCD1-204	ENST00000547637	PFKL	P17858	780 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMARCD1-204	ENST00000547637	HDC	P19113	662 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMARCD1-204	ENST00000547637	GRIK1	P39086	918 aa		24.7	■■□□□ 1.54

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