RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 STK24Q9Y6E0 443 aa25.5■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 PPEF2O14830 753 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 AP5Z1O43299 807 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TYMPP19971 482 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 PROZP22891 400 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 LRPAP1P30533 357 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TIE1P35590 1138 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF33AQ06730 810 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 NR1H3Q13133 447 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 STK3Q13188 491 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 NR5A1Q13285 461 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SLC14A1Q13336 389 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SLC22A12Q96S37 553 aa25.49■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SYPP08247 313 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 EMC10Q5UCC4 262 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.48■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 J3QKU1 62 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 CXCL8P10145 99 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 ITPKBP27987 946 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 PEX3P56589 373 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 KCNB2Q92953 911 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SENP8Q96LD8 212 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 TCHHQ07283 1943 aa25.47■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 CBFA2T3O75081 653 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 GPR15P49685 360 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MESP2Q0VG99 397 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 USP4Q13107 963 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 GAB4Q2WGN9 574 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 KIFAP3Q92845 792 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 MTMR9Q96QG7 549 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 SCN1AP35498 2009 aa25.46■■□□□ 1.67
PRDM4-202ENST00000547188 NEMFO60524 1076 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TADA3O75528 432 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ODC1P11926 461 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 NPTX2P47972 431 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PLEKHG6Q3KR16 790 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PNMA5Q96PV4 448 aa25.45■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 FAM149AA5PLN7 773 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SLC6A11P48066 632 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 GLRX5Q86SX6 157 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ADAM23O75077 832 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CKMP06732 381 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ZBTB6Q15916 424 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SPTA1P02549 2419 aa25.43■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 NFATC1O95644 943 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 LILRA4P59901 499 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CAMK2BQ13554 666 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 EOGTQ5NDL2 527 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TNFRSF25Q93038 417 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 HSPA12BQ96MM6 686 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PRORYQ9H606 182 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.42■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 USP17L7P0C7H9 530 aa25.41■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 XBP1P17861 261 aa25.41■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.41■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.41■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 KNTC1P50748 2209 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PQD8 194 aa25.4■■□□□ 1.66
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