RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546480.1

VENTXP3-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP3, Length 773 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP3-201ENST00000546480 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 MTSS1LQ765P7 747 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ACOT1Q86TX2 421 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SEMA4DQ92854 862 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC35C1Q96A29 364 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 PKMYT1Q99640 499 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ABCB6Q9NP58 842 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NME7Q9Y5B8 376 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.68□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ATP8B3O60423 1300 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FGF19O95750 216 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CSH1P0DML2 217 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CSH2P0DML3 217 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FMO5P49326 533 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CYP4F8P98187 520 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF394Q53GI3 561 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM171BQ6P995 826 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 PARM1Q6UWI2 310 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TMC8Q8IU68 726 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 EDAQ92838 391 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FGF14Q92915 247 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 KXD1Q9BQD3 176 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.67□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CLDN5O00501 218 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TRIM66O15016 1216 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CDC25CP30307 473 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 GPR158Q5T848 1215 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 GDE1Q9NZC3 331 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.66□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NOTCH4Q99466 2003 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CFHP08603 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 CCDC130P13994 396 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 RFX1P22670 979 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ADORA2BP29275 332 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 MAGEA11P43364 429 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 KCNH2Q12809 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 HTR4Q13639 388 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 VSTM1Q6UX27 236 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM35AQ86V20 835 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 UNC93AQ86WB7 457 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TTC16Q8NEE8 873 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TATDN2Q93075 761 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NXPE3Q969Y0 559 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 BCO2Q9BYV7 579 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.65□□□□□ -0.06
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM221A6NGB7 291 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 F8VP50 259 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 M0R296 226 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 DPYSL4O14531 572 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MOSPD3O75425 235 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 AP1G2O75843 785 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MICAL2O94851 1124 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 EPHA5P54756 1037 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 C12orf29Q8N999 325 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.64□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms