RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.34■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.34■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 WNT16Q9UBV4 365 aa23.34■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.34■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 P4HA1P13674 534 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 GTF2H1P32780 548 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 MAGEA11P43364 429 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 GPC5P78333 572 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 CYP27A1Q02318 531 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 CAMK4Q16566 473 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 SIX5Q8N196 739 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 PCED1BQ96HM7 432 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 ZFP14Q9HCL3 533 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
PUS1-211ENST00000544662 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CSH1P0DML2 217 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CSH2P0DML3 217 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 BDNFP23560 247 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CDC25CP30307 473 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 KRT39Q6A163 491 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CA14Q9ULX7 337 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 STX10O60499 249 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ASPAP45381 313 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CYP4F8P98187 520 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GPR158Q5T848 1215 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 VSTM1Q6UX27 236 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NELFBQ8WX92 580 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GCNAQ96QF7 691 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.31■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 OBSL1O75147 1896 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 KRBA1A5PL33 1030 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 LRRN2O75325 713 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NOL4O94818 638 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 VIPR2P41587 438 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 MXI1P50539 228 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NLRP12P59046 1061 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TTI2Q6NXR4 508 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TRIOO75962 3097 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 BICDL2A1A5D9 508 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 F11P03951 625 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NPR3P17342 541 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GRIK1P39086 918 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GRM2Q14416 872 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 FLCNQ8NFG4 579 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 SEMA4DQ92854 862 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TNIP3Q96KP6 325 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CEP63Q96MT8 703 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 BCO2Q9BYV7 579 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TASP1Q9H6P5 420 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 CLDN5O00501 218 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 AVPR2P30518 371 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NDST1P52848 882 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 VITQ6UXI7 678 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ACOT1Q86TX2 421 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 SPATA17Q96L03 361 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 MYRFLQ96LU7 910 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PUS1-211ENST00000544662 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms