RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DNASE1L2Q92874 299 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM81BQ96LP2 452 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MYADMQ96S97 322 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT15Q9BQS2 421 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 IER2Q9BTL4 223 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BCO2Q9BYV7 579 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CXCL16Q9H2A7 254 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BRD9Q9H8M2 597 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPV5Q9NQA5 729 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 COMMD8Q9NX08 183 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DACH1Q9UI36 760 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIP11Q15643 1979 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAST4O15021 2626 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SPEGQ15772 3267 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 A8MXQ7 604 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRDO14764 452 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KLRC4O43908 158 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 AOC1P19801 751 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRR2P28476 465 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PIK3CAP42336 1068 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA5P54756 1037 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NRLP54845 237 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN10P78369 228 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP27A1Q02318 531 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC32Q14392 662 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT39Q6A163 491 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 UNC93AQ86WB7 457 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FLCNQ8NFG4 579 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HPS3Q969F9 1004 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA17Q96L03 361 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP63Q96MT8 703 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB16Q96NS5 453 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GBP4Q96PP9 640 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MED10Q9BTT4 135 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TASP1Q9H6P5 420 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP3A43Q9HB55 503 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DMAC2Q9NW81 257 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SIX4Q9UIU6 781 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 L1RE1Q9UN81 338 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZZEF1O43149 2961 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PRU2 124 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTLC1O15269 473 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CHADO15335 359 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC24AO95486 1093 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TPM2P07951 284 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ADRB1P08588 477 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CFHP08603 1231 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PDGFRBP09619 1106 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4Q2P0C623 313 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L7P0C7H9 530 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC192P0DO97 292 aa5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms