RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 AVPR1AP37288 418 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 MAGEA9P43362 315 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 TNNC1P63316 161 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 CYP27A1Q02318 531 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 STK4Q13043 487 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 PSMD6Q15008 389 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.65□□□□□ -0.86
LMO3-222ENST00000540445 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 TTC8Q8TAM2 541 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 SPATA18Q8TC71 538 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.65□□□□□ -0.86
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LMO3-222ENST00000540445 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 EML5Q05BV3 1969 aa9.64□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 A8MXQ7 604 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 ZNF202O95125 648 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 KIF20AO95235 890 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 ATICP31939 592 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CASP4P49662 377 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 AP3M2P53677 418 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CCDC142Q17RM4 750 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CFAP221Q4G0U5 840 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 PKMYT1Q99640 499 aa9.63□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 HINFPQ9BQA5 517 aa9.63□□□□□ -0.87
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