RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NACC2Q96BF6 587 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM209Q96SK2 561 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NACA2Q9H009 215 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MROH8Q9H579 483 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PRG0 241 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MCM5P33992 734 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CASP2P42575 452 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLMAPQ14BN4 828 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM240Q5SV17 173 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 HHATQ5VTY9 493 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MB21D1Q8N884 522 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ERP27Q96DN0 273 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CLIC6Q96NY7 704 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CABP5Q9NP86 173 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 FCER1AP12319 257 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 AKR1A1P14550 325 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZNF24P17028 368 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RPS6KA3P51812 740 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ACLYP53396 1101 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 POSTNQ15063 836 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LOXL4Q96JB6 756 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 C8orf49Q96NF6 230 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MYH7P12883 1935 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SCN5AQ14524 2016 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MYH4Q9Y623 1939 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GNAI3P08754 354 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CSF2RAP15509 400 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PLCD1P51178 756 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GABPAQ06546 454 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PLS1Q14651 629 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RAB30Q15771 203 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 C11orf74Q86VG3 221 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 INCENPQ9NQS7 918 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ST7Q9NRC1 585 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MKS1Q9NXB0 559 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PTPRSQ13332 1948 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PRQ8 180 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 FLOT1O75955 427 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SMC2O95347 1197 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PGK2P07205 417 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZNF20P17024 532 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ENPP1P22413 925 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 IL4RP24394 825 aa8.55□□□□□ -1.04
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