RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533915.5

CMTM1-218, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 899 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-218ENST00000533915 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SPATA31D3P0C874 917 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 EPCAMP16422 314 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 ANXA13P27216 316 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 HOXA9P31269 272 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 KLK7P49862 253 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 EPHB3P54753 998 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 APBA1Q02410 837 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 DUSP4Q13115 394 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 VEPH1Q14D04 833 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 PCED1BQ96HM7 432 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 PKMYT1Q99640 499 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 EHD2Q9NZN4 543 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 HESX1Q9UBX0 185 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 MYH10P35580 1976 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-218ENST00000533915 F8VZ95 297 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 HCRTO43612 131 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ZMYND10O75800 440 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 NOL4O94818 638 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FAM200BP0CF97 657 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 SOX5P35711 763 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 PBX1P40424 430 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ZNF132P52740 706 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ORC1Q13415 861 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 TAF12Q16514 161 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CES5AQ6NT32 575 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ITIH5Q86UX2 942 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 PPM1EQ8WY54 764 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 TWNKQ96RR1 684 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 COG5Q9UP83 839 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ASB3Q9Y575 518 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 A0A1W2PQJ5 194 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 POU2F2P09086 479 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 BDNFP23560 247 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 GNA15P30679 374 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 GRIK1P39086 918 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 PDE6CP51160 858 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ITIH3Q06033 890 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 KCNC3Q14003 757 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 COL19A1Q14993 1142 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FAM35AQ86V20 835 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 VSTM4Q8IW00 320 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 C12orf29Q8N999 325 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 HLA-CQ95604 372 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CEP83Q9Y592 693 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 NME7Q9Y5B8 376 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 PLXNA3P51805 1871 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CYP26A1O43174 497 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 THAP12O43422 761 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 AP1G2O75843 785 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 SEC24AO95486 1093 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CCDC130P13994 396 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FERP16591 822 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CYP2F1P24903 491 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ADORA2BP29275 332 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 KRT9P35527 623 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ZNF75DP51815 510 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 JAM2P57087 298 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 ZBED6P86452 979 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 CNGA2Q16280 664 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 MEA1Q16626 185 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-218ENST00000533915 FUKQ8N0W3 1084 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms