RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524255.5

SFTPC-210, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SFTPC, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-210ENST00000524255 EPCAMP16422 314 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 MFAP3P55082 362 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 PTPN14Q15678 1187 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 PSMD5Q16401 504 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 IQCEQ6IPM2 695 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 ZNF280DQ6N043 979 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 GPR65Q8IYL9 337 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 CISHQ9NSE2 258 aa18.09■□□□□ 0.49
SFTPC-210ENST00000524255 A8MXQ7 604 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 EPHB6O15197 1021 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 HCRTO43612 131 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 LILRB3O75022 631 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 PDGFRBP09619 1106 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 LMO2P25791 158 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 PBX1P40424 430 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TTC39CQ8N584 583 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 GANQ9H2C0 597 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 MTRRQ9UBK8 725 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.08■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NPR3P17342 541 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RFX1P22670 979 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ZNF75DP51815 510 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NDST1P52848 882 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 INCA1Q0VD86 236 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ACBD6Q9BR61 282 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NME7Q9Y5B8 376 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.07■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 OR6C75A6NL08 312 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TBC1D4O60343 1298 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CILPO75339 1184 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 AOC1P19801 751 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ACO1P21399 889 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 PCSK1P29120 753 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ARPP19P56211 112 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CREMQ03060 361 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ORC1Q13415 861 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ANGPT1Q15389 498 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ZNF394Q53GI3 561 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 UNC93AQ86WB7 457 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 UBR7Q8N806 425 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TMEM209Q96SK2 561 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 FNIP2Q9P278 1114 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CDH9Q9ULB4 789 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 IRAK3Q9Y616 596 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.06■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TSC2P49815 1807 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CACNA1AO00555 2505 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TEX28O15482 410 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ADAM12O43184 909 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 ATP2C2O75185 946 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 KRT5P13647 590 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 OR1D2P34982 312 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 USP8P40818 1118 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TSPY1Q01534 308 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TMEM270Q6UE05 265 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 VSTM4Q8IW00 320 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 WHAMMQ8TF30 809 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 TWNKQ96RR1 684 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 SYT15Q9BQS2 421 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NUP58Q9BVL2 599 aa18.05■□□□□ 0.48
SFTPC-210ENST00000524255 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms