RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NLC8	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT5	O00445	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NRP1	O14786	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NPR1	P16066	1061 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GNAT2	P19087	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FPR1	P21462	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FGFR2	P21802	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PCSK1	P29120	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NPEPPS	P55786	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TAP1	Q03518	808 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP2	Q05923	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKG2	Q13237	762 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM49B-222	ENST00000522702	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ENM7	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO1F	O00160	1098 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PODXL	O00592	558 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G6	O60733	806 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR32	O75388	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GFPT2	O94808	682 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TBX18	O95935	607 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL4	P12829	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TYR	P14679	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	DDC	P20711	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MAL	P21145	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CASR	P41180	1078 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LIFR	P42702	1097 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PER3	P56645	1201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C21orf58	P58505	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SP140	Q13342	867 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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