RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MTERF2Q49AM1 385 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 NACC1Q96RE7 527 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ECSITQ9BQ95 431 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.61□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK1Q14185 1865 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP69A5D8W1 941 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 E2F6O75461 281 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFZP0C0S5 128 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 VPS41P49754 854 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 GALCP54803 685 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 DSG1Q02413 1049 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 RINLQ6ZS11 566 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFVQ71UI9 128 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SV2BQ7L1I2 683 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 NPHS2Q9NP85 383 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC63Q05C16 580 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 CDC16Q13042 620 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP9Q7RTR0 991 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 CATSPER2Q96P56 530 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 TMEM110Q86TL2 294 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 ART4Q93070 314 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 OLFM3Q96PB7 478 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 COL20A1Q9P218 1284 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1024Q9UPX6 916 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 AKT3Q9Y243 479 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 VILLO15195 856 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MLH1P40692 756 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR2P61160 394 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PSMC5P62195 406 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 IL9RQ01113 521 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 EPHA7Q15375 998 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.59□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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TRPS1-211ENST00000520276 C17orf50Q8WW18 174 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 LZICQ8WZA0 190 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 COPS5Q92905 334 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TTC1Q99614 292 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TCHPQ9BT92 498 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SUN2Q9UH99 717 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MEIS1O00470 390 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 MSH4O15457 936 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PHF2O75151 1096 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 CABYRO75952 493 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD12P35452 270 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R2P41236 205 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 OVGP1Q12889 678 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 KLC3Q6P597 504 aa10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10.59□□□□□ -0.71
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