RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TPH2	Q8IWU9	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FANCB	Q8NB91	859 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LRGUK	Q96M69	825 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NELL2	Q99435	816 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760		A1L4Q6	167 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD62	A6NC57	917 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	QSOX1	O00391	747 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	OFD1	O75665	1012 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NXPH3	O95157	252 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PDE8B	O95263	885 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PRR35	P0CG20	571 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CYP2D6	P10635	497 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ADORA2A	P29274	412 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PDE1A	P54750	535 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LOXL3	P58215	753 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF425	Q6IV72	752 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760		A0A088AWK7	358 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ERC2	O15083	957 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TP73	O15350	636 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	AKAP10	O43572	662 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TLR5	O60602	858 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	JTB	O76095	146 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	UBXN7	O94888	489 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	VNN1	O95497	513 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CSF1R	P07333	972 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NPR1	P16066	1061 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	HTR1B	P28222	390 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SLC11A2	P49281	568 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RAB27A	P51159	221 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RAB1A	P62820	205 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MYO1E	Q12965	1108 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		3.71	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM233	B4DJY2	109 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	PRRT4	C9JH25	899 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	PDGFRB	P09619	1106 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	KIT	P10721	976 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	VCAM1	P19320	739 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	CTBP1	Q13363	440 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	E2F2	Q14209	437 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	FGL2	Q14314	439 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CDK1-208	ENST00000519760	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		3.71	□□□□□ -1.82

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