RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 UNC93AQ86WB7 457 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF653Q96CK0 615 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ENC1O14682 589 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ADAM12O43184 909 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GNG11P61952 73 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PDE4CQ08493 712 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PTPN14Q15678 1187 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CNGA2Q16280 664 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MON1BQ7L1V2 547 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF677Q86XU0 584 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 IGSF21Q96ID5 467 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MED10Q9BTT4 135 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KCND1Q9NSA2 647 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MYO9BQ13459 2157 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SOAT2O75908 522 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ERBB2P04626 1255 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CYP11A1P05108 521 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PTP4A2Q12974 167 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 METTL23Q86XA0 190 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SLC35F6Q8N357 371 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 HERVK_113Q902F9 699 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MYLPFQ96A32 169 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 DNAI1Q9UI46 699 aa16.43■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PTPRDP23468 1912 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 80.4
TRPS1-206ENST00000517323 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TLL1O43897 1013 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TNNT1P13805 278 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 LHX1P48742 406 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 DNA2P51530 1060 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KRT82Q9NSB4 513 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PJA2O43164 708 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MED7O43513 233 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NCK2O43639 380 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 EFCAB14O75071 495 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GZMAP12544 262 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 BDNFP23560 247 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MAP3K7CLP57077 242 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PDCLQ13371 301 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TAF5Q15542 800 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TNIP3Q96KP6 325 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD62A6NC57 917 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 E5RJQ4 531 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KRT86O43790 486 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GRAP2O75791 330 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MMP8P22894 467 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PKDCCQ504Y2 493 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GPR152Q8TDT2 470 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF558Q96NG5 402 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PKMYT1Q99640 499 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NUP85Q9BW27 656 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MIS12Q9H081 205 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.41■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FTCDO95954 541 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM253P0C7T8 217 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FGFR3P22607 806 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CYP2F1P24903 491 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ANXA13P27216 316 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PBX2P40425 430 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GPR15P49685 360 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ERICH1Q86X53 443 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms