RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DPPA5	A6NC42	116 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC16A4	O15374	487 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TOM1	O60784	492 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC6	O75061	913 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAG7	O75391	227 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CFB	P00751	764 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IL1B	P01584	269 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FES	P07332	822 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ACADS	P16219	412 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH3A1	P30838	453 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF132	P52740	706 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UBXN2A	P68543	259 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TCP10	Q12799	353 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC3	Q13217	504 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAMLD1	Q13495	774 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MORF4L2	Q15014	288 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAZ	Q16635	292 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UGCG	Q16739	394 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TKFC	Q3LXA3	575 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC38	Q5VT99	294 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF365	Q70YC5	407 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SV2A	Q7L0J3	742 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VSIG1	Q86XK7	387 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UBR7	Q8N806	425 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP120	Q8N960	986 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IL31RA	Q8NI17	732 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ACER1	Q8TDN7	264 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNN1	Q92952	543 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SAAL1	Q96ER3	474 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF333	Q96JL9	665 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf72	Q96LT7	481 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB20	Q9NX57	234 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	COL20A1	Q9P218	1284 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TBK1	Q9UHD2	729 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HAO1	Q9UJM8	370 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746		E7ESA3	106 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	AHCYL1	O43865	530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM155B	O75949	473 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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