RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ABCC3O15438 1527 aa2.53□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 ATP10AO60312 1499 aa2.53□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 USO1O60763 962 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MATN4O95460 622 aa2.53□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SGPL1O95470 568 aa2.53□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 TBX18O95935 607 aa2.53□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AMY1AP04745 511 aa2.53□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 C3P01024 1663 aa2.53□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 IL13RA1P78552 427 aa2.53□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 LAMC1P11047 1609 aa2.52□□□□□ -2.01
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