RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506928.5

POLK-208, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 5

Gene POLK, Length 3,820 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-208	ENST00000506928	LTF	P02788	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TUBB4A	P04350	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ALAD	P13716	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MAGEA9	P43362	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NEK4	P51957	841 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	DSC2	Q02487	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SNX27	Q96L92	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRG1	P02750	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FGF4	P08620	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CASP5	P51878	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CCNG1	P51959	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ITGA8	P53708	1063 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SLC8A3	P57103	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	STARD3	Q14849	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZACN	Q401N2	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FUT11	Q495W5	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CARD9	Q9H257	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928		E7ENQ6	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FZD9	O00144	591 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	SOD2	P04179	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PSAP	P07602	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	RET	P07949	1114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PAM	P19021	973 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	MFAP3	P55082	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLK-208	ENST00000506928	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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