RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CEP68	Q76N32	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MEIS3	Q99687	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DSE	Q9UL01	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ELP1	O95163	1332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RAD50	Q92878	1312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NEO1	Q92859	1461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HIP1	O00291	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KCNK3	O14649	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NCK2	O43639	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TUBB4A	P04350	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TSHR	P16473	764 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EDNRB	P24530	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PSMA5	P28066	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MAPK10	P53779	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MPP1	Q00013	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FOXO1	Q12778	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MALL	Q13021	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PRKG2	Q13237	762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SPIDR	Q14159	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PRSS38	A1L453	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	POM121B	A6NF01	834 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	C22orf46	C9J442	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CTAGE5	O15320	804 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	IRAK2	O43187	625 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CCP110	O43303	1012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	IL18RAP	O95256	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NUDT3	O95989	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	VDR	P11473	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	COL6A2	P12110	1019 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TNNT1	P13805	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CAPN3	P20807	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SYT1	P21579	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EPHA5	P54756	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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