RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.89□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PARVAQ9NVD7 372 aa9.89□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.89□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 KLF15Q9UIH9 416 aa9.89□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 EXTL3O43909 919 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ECE2O60344 883 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SPAG6O75602 509 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ITGAVP06756 1048 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 KRT16P08779 473 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 EPXP11678 715 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ATP4AP20648 1035 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 POLD1P28340 1107 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 GDF10P55107 478 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PSMD6Q15008 389 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 TKFCQ3LXA3 575 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 HHATQ5VTY9 493 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 AADACL2Q6P093 401 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 MON1BQ7L1V2 547 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 LDHDQ86WU2 507 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 FAM151AQ8WW52 585 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 LPAR1Q92633 364 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CHST7Q9NS84 486 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 STOML1Q9UBI4 398 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.88□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 MYPNQ86TC9 1320 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 A6NHS1 94 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CCDC22O60826 627 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 DIAPH2O60879 1101 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 DNAJC6O75061 913 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 STAM2O75886 525 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PIGRP01833 764 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ADRB2P07550 413 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 FURINP09958 794 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 WEE2P0C1S8 567 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ACADSP16219 412 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 GNAZP19086 355 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ATP6V1C1P21283 382 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ADSSP30520 456 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CHKAP35790 457 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SATB1Q01826 763 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 GRIK3Q13003 919 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 GRM1Q13255 1194 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 KRT72Q14CN4 511 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SURF1Q15526 300 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 KSR1Q8IVT5 923 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ALLCQ8N6M5 410 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SEMA4DQ92854 862 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 SAAL1Q96ER3 474 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CDHR1Q96JP9 859 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 CSRNP1Q96S65 589 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 VCXQ9H320 206 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 POLIQ9UNA4 740 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PPME1Q9Y570 386 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.86□□□□□ -0.83
HULC-201ENST00000503668 A8MXQ7 604 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms