RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 OXTRP30559 389 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 OPRD1P41143 372 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GRIA2P42262 883 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 KRT79Q5XKE5 535 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GKN1Q9NS71 199 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CDH9Q9ULB4 789 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 POLIQ9UNA4 740 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GDF9O60383 454 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 AIFM3Q96NN9 605 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FIZ1Q96SL8 496 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CDC6Q99741 560 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 LHX6Q9UPM6 363 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 LACTBL1A8MY62 500 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 YKT6O15498 198 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 NFICP08651 508 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GAP43P17677 238 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CD72P21854 359 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PCSK1P29120 753 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 TSPY1Q01534 308 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP4Q13115 394 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 NR5A1Q13285 461 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 NBR1Q14596 966 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 HASPINQ8TF76 798 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FOXJ1Q92949 421 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO10Q9UK96 956 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 RNF40O75150 1001 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CRY1Q16526 586 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 KIF12Q96FN5 646 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PNKPQ96T60 521 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FAM186AA6NE01 2351 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 BTBD18B2RXH4 712 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ADH1CP00326 375 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-210ENST00000503258 C4orf47A7E2U8 309 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 OPHN1O60890 802 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 CPA1P15085 419 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 PNMA5Q96PV4 448 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-210ENST00000503258 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.3□□□□□ -1.08
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