RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 ANTXRLA6NF34 631 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TSPAN1O60635 241 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 OPHN1O60890 802 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ERLIN2O94905 339 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 LYPLA2O95372 231 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 AKAP5P24588 427 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 RPA1P27694 616 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CCR10P46092 362 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 DMC1Q14565 340 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 STK38Q15208 465 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 HYIQ5T013 277 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ATL3Q6DD88 541 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 KCNK18Q7Z418 384 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 C11orf74Q86VG3 221 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CEP57Q86XR8 500 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TPH2Q8IWU9 490 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 RNF149Q8NC42 400 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 E2F7Q96AV8 911 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 EPSTI1Q96J88 318 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PNMA5Q96PV4 448 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CSRNP2Q9H175 543 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 KLK14Q9P0G3 267 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.14□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087X0B3 334 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SPTLC2O15270 562 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 FECHP22830 423 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 RFC5P40937 340 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 DGKEP52429 567 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ROR1Q01973 937 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 GRIK3Q13003 919 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 EMC2Q15006 297 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 MAPK6Q16659 721 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 XKR9Q5GH70 373 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SHC4Q6S5L8 630 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA18Q8TC71 538 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 WBP1Q96G27 269 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 AK8Q96MA6 479 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 HPS4Q9NQG7 708 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 E9PMD0 336 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PTGESO14684 152 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ASAP2O43150 1006 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 B4GALT5O43286 388 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 NPTXRO95502 500 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 LRG1P02750 347 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ATF2P15336 505 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 MUTP22033 750 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 ITPKAP23677 461 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 P2RY2P41231 377 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 RARRES1P49788 294 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 GALK1P51570 392 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 PTENP60484 403 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 KRT85P78386 507 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 SLC14A1Q13336 389 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 AMHR2Q16671 573 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 KRT79Q5XKE5 535 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf135-204ENST00000495399 NOTUMQ6P988 496 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms