RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KCNA1Q09470 495 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ASB7Q9H672 318 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ANKS3Q6ZW76 656 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GRID1Q9ULK0 1009 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PCSK7Q16549 785 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZNF410Q86VK4 478 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 REXO1L1PQ8IX06 675 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLITRK3O94933 977 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZNF280DQ6N043 979 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ECT2Q9H8V3 914 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PKP3Q9Y446 797 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 F8VZ95 297 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MYO1CO00159 1063 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KRT4P19013 534 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-24P63145 666 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LONRF1Q17RB8 773 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MEI1Q5TIA1 1274 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM71DQ8N9W8 422 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TAS1R2Q8TE23 839 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FBXO32Q969P5 355 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CNPY3Q9BT09 278 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LATS2Q9NRM7 1088 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TCP11X1B4DZS4 312 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CDH18Q13634 790 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FBXO47Q5MNV8 452 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SV2AQ7L0J3 742 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 YY1AP1Q9H869 796 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CISHQ9NSE2 258 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 F5H5T6 163 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GUCY1A3Q02108 690 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LZICQ8WZA0 190 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TASP1Q9H6P5 420 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MYL2P10916 166 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MTA1Q13330 715 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LY6KQ17RY6 165 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CTXN3Q4LDR2 81 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 IQSEC1Q6DN90 963 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 LCA5Q86VQ0 697 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 DPP7Q9UHL4 492 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM86B1E9PN63 330 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 H0Y626 953 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8RI6L899 631 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 URODP06132 367 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SHCBP1Q8NEM2 672 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CPB2Q96IY4 423 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ETFBP38117 255 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PPIL2Q13356 520 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KDM1AO60341 852 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 CHN1P15882 459 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 INHBEP58166 350 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TRIML2Q8N7C3 387 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TMEM51Q9NW97 253 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 YY1P25490 414 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KCNJ1P48048 391 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MYL6P60660 151 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MAPK7Q13164 816 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 KYNUQ16719 465 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM161BQ96MY7 647 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 NAT9Q9BTE0 207 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 SETD4Q9NVD3 440 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 AK9Q5TCS8 1911 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 PTPRAP18433 802 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-213ENST00000489895 ADORA2AP29274 412 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms