RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 RALBP1Q15311 655 aa5.97□□□□□ -1.45
CCL20-204ENST00000489160 GEN1Q17RS7 908 aa5.97□□□□□ -1.45
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CCL20-204ENST00000489160 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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CCL20-204ENST00000489160 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.96□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.95□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 SYNE4Q8N205 404 aa5.94□□□□□ -1.46
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