RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	APAF1	O14727	1248 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1QL1	O75973	258 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ESRRB	O95718	433 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	BPI	P17213	487 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TM4SF4	P48230	202 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL2	P60568	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAST3	O60307	1309 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPEF2	Q9C093	1822 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MATN4	O95460	622 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAST	P01350	101 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGKV5-2	P06315	115 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	NF2	P35240	595 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MST1L	Q2TV78	715 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	DACT2	Q5SW24	774 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MOB2	Q70IA6	237 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	APPBP2	Q92624	585 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	NACC2	Q96BF6	587 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	COA1	Q9GZY4	146 aa		5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CSF1R	P07333	972 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ITGAM	P11215	1152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXCR5	P32302	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CRHR1	P34998	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	AVPR1B	P47901	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FLT3LG	P49771	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SOX10	P56693	466 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLRN1	P58418	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q96MF0	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	GREM2	Q9H772	168 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEMP1	O14524	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC6A2	P23975	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	MGAT1	P26572	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	OCRL	Q01968	901 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	OCA2	Q04671	838 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	GCKR	Q14397	625 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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