RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ACBD6Q9BR61 282 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 EBF3Q9H4W6 596 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 GKN1Q9NS71 199 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 RAB23Q9ULC3 237 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SPTBN2O15020 2390 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF292O60281 2723 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 BDNFP23560 247 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 LMO2P25791 158 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD13P35453 343 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA9P43362 315 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CYP24A1Q07973 514 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCB1Q12824 385 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC32Q14392 662 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RESP18Q5W5W9 173 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CEP135Q66GS9 1140 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 DPH6Q7L8W6 267 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 WDR49Q8IV35 697 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FSIP1Q8NA03 581 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MYLPFQ96A32 169 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PAGE5Q96GU1 130 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MED10Q9BTT4 135 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CCL26Q9Y258 94 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CACNA1GO43497 2377 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 A8MXQ7 604 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TGFB1I1O43294 461 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SLFN14P0C7P3 912 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ARSAP15289 507 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 PFKFB1P16118 471 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CTHP32929 405 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL12P48061 93 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FNTBP49356 437 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MYL6P60660 151 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KRT85P78386 507 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SATB1Q01826 763 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KCNB1Q14721 858 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZS52 159 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 RUBCNQ92622 972 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN23Q96B33 292 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CGRRF1Q99675 332 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 IL21Q9HBE4 155 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 TDP1Q9NUW8 608 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 CDH9Q9ULB4 789 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-209ENST00000480420 USP18Q9UMW8 372 aa8.63□□□□□ -1.03
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