RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	CISH	Q9NSE2	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	PTPN2	P17706	415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	BDNF	P23560	247 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	FSHR	P23945	695 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	GPR15	P49685	360 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF165	P49910	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	LRMP	Q12912	555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ORC1	Q13415	861 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	KRT31	Q15323	416 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ACOT1	Q86TX2	421 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ITIH5	Q86UX2	942 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	FAM35A	Q86V20	835 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	KAT5	Q92993	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	C8orf48	Q96LL4	319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	CORO1B	Q9BR76	489 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SFI1-222	ENST00000478887	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CLDN5	O00501	218 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM66	O15016	1216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MOSPD3	O75425	235 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	NOL4	O94818	638 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MICAL2	O94851	1124 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CSH1	P0DML2	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CSH2	P0DML3	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC130	P13994	396 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CCR2	P41597	374 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	RAD23B	P54727	409 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	IQCB1	Q15051	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GJD3	Q8N144	294 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ITFG1	Q8TB96	612 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA17	Q96L03	361 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MYADM	Q96S97	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CD320	Q9NPF0	282 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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